RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM22Q9P0K1 906 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 ACANP16112 2415 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 RYR3Q15413 4870 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-211ENST00000489450 ESPL1Q14674 2120 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.21□□□□□ -2.063e-10■■■□□ 18.1
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF35A5YM69 484 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PANO1I0J062 215 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKYO43930 277 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF861PO60384 105 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NEMFO60524 1076 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 HCN1O60741 890 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PFKFB2O60825 505 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 GNA14O95837 355 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV1-47P01700 117 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSLP07711 333 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CLTAP09496 248 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC130P13994 396 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 DESP17661 470 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 F8A1P23610 371 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 HPDP32754 393 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CD70P32970 193 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LEPP41159 167 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TUFMP49411 452 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CASP4P49662 377 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKXP51817 358 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PSG7Q13046 419 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ATRQ13535 2644 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SELPLGQ14242 412 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC36A3Q495N2 470 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ATL3Q6DD88 541 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM71F2Q6NXP2 309 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM220AQ7Z4H9 259 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM110Q86TL2 294 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TPRA1Q86W33 373 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CLDN19Q8N6F1 224 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2AP1Q8NGE2 309 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2T3Q8NH03 318 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf33Q8WU49 177 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK6Q92876 244 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 BMFQ96LC9 184 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ACBD6Q9BR61 282 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG12Q9BV10 488 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPM6Q9BX84 2022 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA16Q9BXB7 569 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB33BQ9H082 229 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RHBGQ9H310 441 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF385DQ9H6B1 395 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB8Q9H765 288 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SMYD3Q9H7B4 428 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC17A5Q9NRA2 495 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 DEC1Q9P2X7 70 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT52Q9Y366 437 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0J9YXY3 114 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RRP8O43159 456 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NOL3O60936 208 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 UGT2B17O75795 530 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SUPT7LO94864 414 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LRATO95237 230 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LALBAP00709 142 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT6AP02538 564 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT8P05787 483 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ALOX5P09917 674 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 H2BFMP0C1H6 154 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RNH1P13489 461 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RPA2P15927 270 aa2.2□□□□□ -2.06
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