RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD9Q7L273 389 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC16A9Q7RTY1 509 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RXFP4Q8TDU9 374 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR148Q8TDV2 347 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SEH1LQ96EE3 360 aa12.25□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 SERINC2Q96SA4 455 aa12.25□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R19P59542 299 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CTXN1P60606 82 aa12.24□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 UPB1Q9UBR1 384 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SHPKQ9UHJ6 478 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNG2Q9UJ96 466 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 APEHP13798 732 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPAP49450 140 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKXP51817 358 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 ACTBP60709 375 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 ACTG1P63261 375 aa12.23□□□□□ -0.45
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