RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PERP	Q96FX8	193 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NOX3	Q9HBY0	568 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ITPR3	Q14573	2671 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MTOR	P42345	2549 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PRSS37	A4D1T9	235 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SOD3	P08294	240 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RAB39A	Q14964	217 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	VHLL	Q6RSH7	139 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GIPC3	Q8TF64	312 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SIAE	Q9HAT2	523 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		15.42	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	AHCYL1	O43865	530 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DANCR	P0C864	163 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CALCR	P30988	508 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CENPA	P49450	140 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PGGHG	Q32M88	737 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NRN1L	Q496H8	165 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	AGAP6	Q5VW22	663 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ADCK1	Q86TW2	530 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SYT4	Q9H2B2	425 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		15.41	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A7	O60669	478 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	TIPRL	O75663	272 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	REN	P00797	406 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GSTM3	P21266	225 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	LAP3	P28838	519 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	TTK	P33981	857 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	HSF2	Q03933	536 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PLP2	Q04941	152 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GK3P	Q14409	553 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ETFDH	Q16134	617 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	LEG1	Q6P5S2	330 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MUC15	Q8N387	334 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR4K13	Q8NH42	304 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		15.4	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IMPA2	O14732	288 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	MGRN1	O60291	552 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SOX14	O95416	240 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TXNDC12	O95881	172 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA5	P05154	406 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CTLA4	P16410	223 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CDKN1A	P38936	164 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARHGDIA	P52565	204 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	GALK2	Q01415	458 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	KRT80	Q6KB66	452 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF544	Q6NX49	715 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NABP1	Q96AH0	204 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NMNAT3	Q96T66	252 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FEV	Q99581	238 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NUAK2	Q9H093	628 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CA10	Q9NS85	328 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		15.39	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	VSTM5	A8MXK1	200 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARPC3	O15145	178 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IDH3B	O43837	385 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05

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