RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 OMGP23515 440 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 STOMP27105 288 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CDAP32320 146 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PCGF2P35227 344 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MPV17P39210 176 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 AQP2P41181 271 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 WNT5AP41221 380 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 GDI2P50395 445 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ATP4BP51164 291 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TAS2R41P59536 307 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PPP1CBP62140 327 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ERVK-25P63136 954 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC3A1Q07837 685 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CD47Q08722 323 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF154Q13106 437 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 BAMBIQ13145 260 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SELPLGQ14242 412 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NPTX1Q15818 432 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SGCAQ16586 387 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF74Q16587 644 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MOGQ16653 247 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 DUSP7Q16829 419 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CYP51A1Q16850 503 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MMEL1Q495T6 779 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 AGKQ53H12 422 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM209AQ5JX71 171 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ENTPD8Q5MY95 495 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PRR31Q5SQ13 230 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR93Q6P2C0 686 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 LEG1Q6P5S2 330 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF613Q6PF04 617 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 EPGNQ6UW88 154 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SHISA2Q6UWI4 295 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TREML4Q6UXN2 200 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 LINC00114Q6XXX2 140 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 DOK3Q7L591 496 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 RETREG3Q86VR2 466 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PTOV1Q86YD1 416 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 FUNDC1Q8IVP5 155 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MREGQ8N565 214 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 HIPK4Q8NE63 616 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 DEFB108BQ8NET1 73 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NOXO1Q8NFA2 376 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 OR6T1Q8NGN1 323 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ABHD4Q8TB40 342 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC25A40Q8TBP6 338 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ASB10Q8WXI3 467 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 EBF4Q9BQW3 602 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MRI1Q9BV20 369 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 PARD6BQ9BYG5 372 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 OR2J1Q9GZK6 312 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 C1orf198Q9H425 327 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM38AQ9H6F2 299 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NTN4Q9HB63 628 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 MSL2Q9HCI7 577 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NPHS2Q9NP85 383 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 EGFL7Q9UHF1 273 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF229Q9UJW7 825 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD109B-201ENST00000458961 NUP50Q9UKX7 468 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms