RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453553.1

USP25-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 3

Gene USP25, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-206ENST00000453553 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CDH17Q12864 832 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NCF4Q15080 339 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ATP6AP1Q15904 470 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GABRA6Q16445 453 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C6orf183Q5T699 404 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GPR157Q5UAW9 335 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NUBPLQ8TB37 319 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MSANTD3Q96H12 275 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C9orf72Q96LT7 481 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KIR2DL4Q99706 377 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SIAEQ9HAT2 523 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IL26Q9NPH9 171 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DUX4Q9UBX2 424 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SAR1BQ9Y6B6 198 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 E7ENQ6 273 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 F6UB75 175 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 K7ERQ8 282 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TNFSF11O14788 317 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CLDN11O75508 207 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KRT16P08779 473 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FOLR1P15328 257 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF250P15622 560 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CTRB1P17538 263 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR1E1P30953 314 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CFHR2P36980 270 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NBL1P41271 181 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 BTDP43251 543 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CCNG1P51959 295 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 UGT2B15P54855 530 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LYZP61626 148 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF92Q03936 586 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TRAM1L1Q8N609 369 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FANK1Q8TC84 345 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TMEM54Q969K7 222 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 EBF4Q9BQW3 602 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACP6Q9NPH0 428 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IFNKQ9P0W0 207 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MSH6P52701 1360 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 YKT6O15498 198 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NMT2O60551 498 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HSBP1O75506 76 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SNAPINO95295 136 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IGHV3-23P01764 117 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FMO3P31513 532 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 BTCP35070 178 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TNFSF9P41273 254 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GPR1P46091 355 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DLX1P56177 255 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF33AQ06730 810 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GGTLC2Q14390 218 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PSMD5Q16401 504 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ASCL4Q6XD76 172 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ARPC1AQ92747 370 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ARHGDIGQ99819 225 aa3.34□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms