RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	AUP1	Q9Y679	476 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GX78	115 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MPC2	O95563	127 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ITGA5	P08648	1049 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CCKBR	P32239	447 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF626	Q68DY1	528 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAM166A	Q6J272	317 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BIVM	Q86UB2	503 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CIB4	A0PJX0	185 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC17A2	O00624	439 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX1	O43812	170 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RBBP9	O75884	186 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR6A2	O95222	327 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SPARC	P09486	303 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CAMK2B	Q13554	666 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TDG	Q13569	410 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ETFDH	Q16134	617 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf189	Q5VU69	101 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SSTR2	P30874	369 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	POU3F4	P49335	361 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CA14	Q9ULX7	337 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MBTPS2	O43462	519 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	AHSA1	O95433	338 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ADAM8	P78325	824 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DHODH	Q02127	395 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RAB11B	Q15907	218 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KRT77	Q7Z794	578 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ABHD6	Q9BV23	337 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CA10	Q9NS85	328 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR2T1	O43869	369 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TOX	O94900	526 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	WNT11	O96014	354 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSF1	P09603	554 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MAP2K6	P52564	334 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PUDP	Q08623	228 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SNTA1	Q13424	505 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSRP2	Q16527	193 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR8H3	Q8N146	312 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FTMT	Q8N4E7	242 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CTSF	Q9UBX1	484 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF69	Q9UC07	566 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA1C	Q13936	2221 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQ72	361 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A4	O95047	310 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CD37	P11049	281 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC26A5	P58743	744 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM225	Q6GV28	225 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MEIOB	Q8N635	442 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ASB5	Q8WWX0	329 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A7	Q96R45	310 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LRP12	Q9Y561	859 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		15.21	■□□□□ 0.03

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