RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MGRN1O60291 552 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 STAMBPO95630 424 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CLPTM1O96005 669 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IGHMP01871 453 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DAOP14920 347 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF32P17041 273 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PRDX6P30041 224 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GLRXP35754 106 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SLC9A3P48764 834 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 VLDLRP98155 873 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FGD3Q5JSP0 725 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OTPQ5XKR4 325 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ZNF519Q8TB69 540 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SLC7A13Q8TCU3 470 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SOX7Q9BT81 388 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CDH20Q9HBT6 801 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IL20RAQ9UHF4 553 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DUSP13Q9UII6 198 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPL8 197 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPW3 197 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IMPA2O14732 288 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LCKP06239 509 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NAT2P11245 290 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CCNOP22674 350 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 HSF2Q03933 536 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SEC23BQ15437 767 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TRIP10Q15642 601 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MESTQ5EB52 335 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 OR52J3Q8NH60 311 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 C7orf34Q96L11 122 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 Q96M85 177 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ALG12Q9BV10 488 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CHODLQ9H9P2 273 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SIAEQ9HAT2 523 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NDUFAF4Q9P032 175 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NDUFS8O00217 210 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NDUFAB1O14561 156 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SYNGR3O43761 229 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NCR1O76036 304 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 HPXP02790 462 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SCG5P05408 212 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LAP3P28838 519 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IL2RGP31785 369 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GLO1Q04760 184 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TAF11Q15544 211 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NRN1LQ496H8 165 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RRM2BQ7LG56 351 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 RASD2Q96D21 266 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MDFIQ99750 246 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 EMC7Q9NPA0 242 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 DYSFO75923 2080 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ARPC2O15144 300 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ENTPD5O75356 428 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IGFBP5P24593 272 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms