RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435165.2

SGIP1-206, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-206ENST00000435165 FGF16O43320 207 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 VIPP01282 170 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 THY1P04216 161 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TSPAN19P0C672 248 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PRLHRP49683 370 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CLCN3P51790 818 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PLP1P60201 277 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 RAP2BP61225 183 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ARHGAP1Q07960 439 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FHL3Q13643 280 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 HSPB2Q16082 182 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PPTC7Q8NI37 304 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 RNF138Q8WVD3 245 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 S100ZQ8WXG8 99 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FCRL5Q96RD9 977 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 JMJD8Q96S16 334 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CCDC32Q9BV29 185 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 LAT2Q9GZY6 243 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FN3KQ9H479 309 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 WDCPQ9H6R7 721 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 HSPB11Q9Y547 144 aa3.4□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 A0A1B0GTI1 187 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CDHR4A6H8M9 788 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 A6NNC1 897 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 F5H768 121 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FKBP6O75344 327 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 MT-ND4P03905 459 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CT62P0C5K7 136 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 KITLGP21583 273 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 MATN1P21941 496 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 S100GP29377 79 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FMO4P31512 558 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 GGT2P36268 569 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CRISP1P54107 249 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PAX9P55771 341 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 GNG11P61952 73 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CTBSQ01459 385 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ID2Q02363 134 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 NPY5RQ15761 445 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CSRP2Q16527 193 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 MAPK14Q16539 360 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TATDN3Q17R31 274 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PYCR3Q53H96 274 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TEX261Q6UWH6 196 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 SHFQ7M4L6 423 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CLDN23Q96B33 292 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 LGALS12Q96DT0 336 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 P2RY11Q96G91 374 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 GPR137Q96N19 417 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 HDAC8Q9BY41 377 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 CLN8Q9UBY8 286 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 KIF25Q9UIL4 384 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 NAGPAQ9UK23 515 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 RFNGQ9Y644 331 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 U3KQ87 197 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 A0A1W2PPV9 198 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 MYADML2A6NDP7 307 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 C17orf105B2RV13 164 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 ACOT8O14734 319 aa3.39□□□□□ -1.87
SGIP1-206ENST00000435165 GYG2O15488 501 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms