RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UMPSP11172 480 aa11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GYS2P54840 703 aa11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSF2Q03933 536 aa11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST3H3Q16695 136 aa11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP7Q16829 419 aa11.18□□□□□ -0.62
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.18□□□□□ -0.62
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.16□□□□□ -0.62
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT14Q8NB59 555 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST7LQ8TDW4 575 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB10Q8WXI3 467 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf26Q96N11 449 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.16□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIAL4DF5H284 164 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0QX08 132 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXH1O75593 365 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGDSO95455 350 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A10O95528 541 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F13BP05160 661 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF32P17041 273 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDH3AP50213 366 aa11.15□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT2B15P54855 530 aa11.15□□□□□ -0.62
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