RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TARM1B6A8C7 271 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 CLDN7O95471 211 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 OR8U8P0C7N1 319 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 OR8U1Q8NH10 309 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ISOC2Q96AB3 205 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 PTPN18Q99952 460 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 C1orf226A1L170 272 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF727A8MUV8 499 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 IGF2P01344 180 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TAF10Q12962 218 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF154Q13106 437 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SKP2Q13309 424 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 RAB35Q15286 201 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 APCDD1Q8J025 514 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGDIGQ99819 225 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 RAB22AQ9UL26 194 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 PSMB10P40306 273 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SULT1A2P50226 295 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SUOXP51687 545 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 MISPQ8IVT2 679 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 EXD3Q8N9H8 876 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 GPR174Q9BXC1 333 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DOBP13765 273 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SLC6A11P48066 632 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 PLXNB2O15031 1838 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 M0QYG6 137 aa5.96□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 ERVFRD-1P60508 538 aa5.96□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.96□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 MAJINQ3KP22 176 aa5.96□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ABHD1Q96SE0 405 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.95□□□□□ -1.46
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SBNO1-202ENST00000420886 LINC00614P0C842 121 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 MYOGP15173 224 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ATP1B3P54709 279 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 RAB31Q13636 194 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 ACER2Q5QJU3 275 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 FAM129CQ86XR2 697 aa5.95□□□□□ -1.46
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.95□□□□□ -1.46
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