RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIAEQ9HAT2 523 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA4P78363 2273 aa15.1■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E7EQL1 145 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IMPA2O14732 288 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARPC3O15145 178 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDAP32320 146 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC18Q8N456 261 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIPC3Q8TF64 312 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT4Q9H2B2 425 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF121Q9H920 327 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOX3Q9HBY0 568 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.09■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PPL8 197 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOD3P08294 240 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DANCRP0C864 163 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PATE4P0C8F1 98 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FABP6P51161 128 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SGCAQ16586 387 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGGHGQ32M88 737 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF544Q6NX49 715 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NABP1Q96AH0 204 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IDH3BO43837 385 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC16A7O60669 478 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSR1P21757 451 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALCRP30988 508 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTKP33981 857 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGDIAP52565 204 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB39AQ14964 217 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGAP6Q5VW22 663 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF75AQ96N20 296 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FEVQ99581 238 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf198Q9H425 327 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL20Q9NYY1 176 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPG11Q96JI7 2443 aa15.07■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIPRLO75663 272 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RENP00797 406 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTHP01270 115 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINA5P05154 406 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTLA4P16410 223 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLP2Q04941 152 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX10Q12887 443 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ETFDHQ16134 617 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM27BQ5VT28 67 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LEG1Q6P5S2 330 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DTX2Q86UW9 622 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MUC15Q8N387 334 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP37Q8NFH4 326 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4K13Q8NH42 304 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX18Q96RF0 628 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RERGLQ9H628 205 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF556Q9HAH1 456 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLE4Q9NR33 117 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CA10Q9NS85 328 aa15.06■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.05■□□□□ 0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX14O95416 240 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CST2P09228 141 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAP3P28838 519 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRABP1P29762 137 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms