RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405053.7

PDE4D-206, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4D, Length 512 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-206ENST00000405053 GGTLC2Q14390 218 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 KCNMB1Q16558 191 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 XKRXQ6PP77 449 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 FOXB1Q99853 325 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 CLN6Q9NWW5 311 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 SNTNA6NMZ2 147 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 ASCL1P50553 236 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 TGFBR3Q03167 851 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 SIAEQ9HAT2 523 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 POLE4Q9NR33 117 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-206ENST00000405053 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 MSR1P21757 451 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-206ENST00000405053 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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