RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363074.1

RNU6-653P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 653, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-653P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-653P-201ENST00000363074 CSPG4P5Q96PW8 444 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 SEC22CQ9BRL7 303 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ACAT2Q9BWD1 397 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM59Q9BXS4 323 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 RAB34Q9BZG1 259 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 EDA2RQ9HAV5 297 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 C8orf17Q9NRJ1 99 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM106BQ9NUM4 274 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMOD2Q9NZR1 351 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF492Q9P255 531 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMCO1Q9UM00 188 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MGAT4BQ9UQ53 548 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MEMO1Q9Y316 297 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 LTBP2Q14767 1821 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ARHGEF35A5YM69 484 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CCDC182A6NF36 153 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 FAM47DPA6NHR8 397 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CEACAM18A8MTB9 384 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CHADO15335 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 KERAO60938 352 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 NDUFB10O96000 172 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ASGR1P07306 291 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF688P0C7X2 276 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CGB3P0DN86 165 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CCDC192P0DO97 292 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ETS1P14921 441 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CBR1P16152 277 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 DRD5P21918 477 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CDKN1BP46527 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 IDH2P48735 452 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 RORCP51449 518 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CRADDP78560 199 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 OGDHQ02218 1023 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CBX3Q13185 183 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 GANABQ14697 944 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PDK1Q15118 436 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 SLC9A3R2Q15599 337 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 C1orf220Q5T0J3 134 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TRIM40Q6P9F5 258 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 LRRC8BQ6P9F7 803 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM179Q6ZVK1 233 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ASCL5Q7RTU5 278 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 HDDC2Q7Z4H3 204 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ANKRD23Q86SG2 305 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 LHFPL3Q86UP9 236 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PRSS58Q8IYP2 241 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 SPC24Q8NBT2 197 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MUC7Q8TAX7 377 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PYROXD1Q8WU10 500 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM54Q969K7 222 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PTX4Q96A99 478 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ATP6V0BQ99437 205 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TIMM17AQ99595 171 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 RARRES2Q99969 163 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 LINC00574Q9H8X3 128 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 SLC2A8Q9NY64 477 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 C21orf62Q9NYP8 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 KDRP35968 1356 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 TRAV39A0A0B4J263 110 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 A0A0B4J2A0 478 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 A0A1W2PRQ8 180 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 OR5B21A6NL26 309 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MANBAO00462 879 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 BTN3A3O00478 584 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MFNGO00587 321 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MGRN1O60291 552 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 REM1O75628 298 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 DIRAS1O95057 198 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 RAB3DO95716 219 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 NTF3P20783 257 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 SERPINB5P36952 375 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PRLHRP49683 370 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PRMT2P55345 433 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 CDK5Q00535 292 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF92Q03936 586 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 KLRB1Q12918 225 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 GAMTQ14353 236 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PGGHGQ32M88 737 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 PTPN20Q4JDL3 420 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 ORMDL2Q53FV1 153 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 MPV17L2Q567V2 206 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-653P-201ENST00000363074 DMRTC1Q5HYR2 192 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms