RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EXD3Q8N9H8 876 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PDXPQ96GD0 296 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF681Q96N22 645 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DDOQ99489 341 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 XRCC2O43543 280 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GPANK1O95872 356 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR5AC1P0C628 307 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RRASP10301 218 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APLNRP35414 380 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BTG2P78543 158 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HTR4Q13639 388 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CST6Q15828 149 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZVU0 165 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LYG2Q86SG7 212 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IFI44Q8TCB0 444 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ASB5Q8WWX0 329 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CMC2Q9NRP2 79 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf119Q9NWQ9 140 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RAB27BO00194 218 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A4P12235 298 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COX5AP20674 150 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KHDC3LQ587J8 217 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NRG4Q8WWG1 115 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SPSB1Q96BD6 273 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf50Q96LR7 162 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD6Q9BV23 337 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TBX21Q9UL17 535 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR5H14A6NHG9 310 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CA11O75493 328 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GCGP01275 180 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GHRHP01286 108 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FAM189BP81408 668 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PKDCCQ504Y2 493 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD4Q8TB40 342 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MZB1Q8WU39 189 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EGLN2Q96KS0 407 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF583Q96ND8 569 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 H0YIG0 161 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACTL6BO94805 426 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MAP4K2Q12851 820 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 Q3ZCU0 254 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR51I2Q9H344 312 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 AMBNQ9NP70 447 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IL17CQ9P0M4 197 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CA14Q9ULX7 337 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PQLC2LA1A4F0 135 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FAM183AA6NL82 134 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HSD17B6O14756 317 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ABLIM3O94929 683 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TXNDC12O95881 172 aa4.53□□□□□ -1.69
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