RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 DUXAA6NLW8 204 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 POU2F2P09086 479 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DUSP5Q16690 384 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FGF14Q92915 247 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 COL26A1Q96A83 441 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 HRH4Q9H3N8 390 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NUDT19A8MXV4 375 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PEX12O00623 359 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 LINC01565O15544 149 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MELTFP08582 738 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DIO1P49895 249 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DUSP8Q13202 625 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MST1LQ2TV78 715 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PARM1Q6UWI2 310 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 BAP18Q8IXM2 172 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 LAT2Q9GZY6 243 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RHOFQ9HBH0 211 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 POM121BA6NF01 834 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SFTA3P0C7M3 94 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SELLP14151 372 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 C5AR1P21730 350 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CPT2P23786 658 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 IGFALSP35858 605 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AQP2P41181 271 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ACTR1AP61163 376 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FHL1Q13642 323 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NUBPLQ8TB37 319 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF681Q96N22 645 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 A0A0B4J2A0 478 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ALOX12BO75342 701 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 POU3F4P49335 361 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R19P59542 299 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TGIF1Q15583 401 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NMNAT3Q96T66 252 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SDF2Q99470 211 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa15.23■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GTH9 108 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF208O43345 1280 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR8U8P0C7N1 319 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ACTBP60709 375 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ACTG1P63261 375 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TMEM205Q6UW68 189 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GPX8Q8TED1 209 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 F8VVB4 439 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 F8VWA3 439 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 EML2O95834 649 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 THBS1P07996 1170 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NGFRP08138 427 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NQO2P16083 231 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AGAP20933 346 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PAX6P26367 422 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms