RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 OR4K15Q8NH41 348 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 FGGYQ96C11 551 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 TCTN2Q96GX1 697 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 PATJQ8NI35 1801 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 H7C417 338 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 STK17BO94768 372 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 IL5P05113 134 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 OR4E1P0C645 316 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 ACHEP22303 614 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 CAMK2DQ13557 499 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 STX12Q86Y82 276 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 UEVLDQ8IX04 471 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 DDIT4LQ96D03 193 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRU-201ENST00000345512 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 DRD1P21728 446 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 SFTPDP35247 375 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CLDN6P56747 220 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CDONQ4KMG0 1287 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 OBP2AQ9NY56 170 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00862A6NCI5 91 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 FBXO24O75426 580 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 RRASP10301 218 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 GLP1RP43220 463 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ZAR1Q86SH2 424 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TEX19Q8NA77 164 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TOMM40LQ969M1 308 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CMTM3Q96MX0 182 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CUTCQ9NTM9 273 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 MYLKQ15746 1914 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 BLACEA4D250 179 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TNFRSF10CO14798 259 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 PMPCAQ10713 525 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ACKR1Q16570 336 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TTC9Q92623 222 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 MARC2Q969Z3 335 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 OGG1O15527 345 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 SNAPINO95295 136 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-DQB1P01920 261 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF43P17038 809 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 MAP2K6P52564 334 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 HERV-K104P61576 105 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CDH26Q8IXH8 852 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TSC2P49815 1807 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 F5H5K5 113 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TSPAN15O95858 294 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM225BP0DP42 221 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TDGQ13569 410 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 GPR137Q96N19 417 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ARPC3O15145 178 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 HSD17B7P56937 341 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRU-201ENST00000345512 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms