RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CTLA4P16410 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CXCR1P25024 350 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PPICP45877 212 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ADAM8P78325 824 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 EGR3Q06889 387 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SLC17A1Q14916 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 RAB11BQ15907 218 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ACKR1Q16570 336 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SPICQ8N5J4 248 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 EID2Q8N6I1 236 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 LIPHQ8WWY8 451 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MCHR2Q969V1 340 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OR8B4Q96RC9 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GSX2Q9BZM3 304 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 B9D1Q9UPM9 204 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CFAP54Q96N23 3096 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 LGALS8O00214 317 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 XKRYO14609 159 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SIGLEC5O15389 551 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A12O75746 678 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OR6A2O95222 327 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IGF2P01344 180 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IL5P05113 134 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CPN1P15169 458 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IL12BP29460 328 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 RORAP35398 523 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SORDQ00796 357 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 DHODHQ02127 395 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 FMODQ06828 376 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SPOCK1Q08629 439 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 BIKQ13323 160 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CCINQ13939 588 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 C4orf46Q504U0 113 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TMUB2Q71RG4 321 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF627Q7L945 461 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GALNT16Q8N428 558 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GPR119Q8TDV5 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF721Q8TF20 911 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 NKD1Q969G9 470 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CYYR1Q96J86 154 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 REG4Q9BYZ8 158 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ADAM19Q9H013 955 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 POFUT1Q9H488 388 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 EXO5Q9H790 373 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GPR27Q9NS67 375 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CUTCQ9NTM9 273 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OPN4Q9UHM6 478 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPC4 97 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms