RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 HMGB4Q8WW32 186 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 FAM227AF5H4B4 570 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 K7ERQ8 282 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF264O43296 627 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GCGP01275 180 aa5.09□□□□□ -1.59
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