RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYL12AP19105 171 aa24.22■■□□□ 1.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PMPCAQ10713 525 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF773Q6PK81 442 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS48Q7RTY5 328 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR35Q9HC97 309 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SELENOFO60613 162 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM211Q6ICI0 200 aa24.21■■□□□ 1.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC16A9Q7RTY1 509 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10H4Q8NGA5 316 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCOCQ9UIL1 159 aa24.21■■□□□ 1.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTA1P68133 377 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM8P78325 824 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXF2Q12947 444 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM16Q2WEN9 425 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW9Q5XUX1 488 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 SVOPQ8N4V2 548 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A10Q8NG04 563 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6N2Q8NGY6 317 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROCRQ9UNN8 238 aa24.2■■□□□ 1.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35F2Q8IXU6 374 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIGD4Q8IY51 512 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACBD7Q8N6N7 88 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDADC1Q9BWV3 514 aa24.2■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS50Q9UI38 385 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPB2A8KAH6 182 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMCC2O75069 709 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPZL1O95297 269 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MT-ND2P03891 347 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENTPD1P49961 510 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPB2Q16082 182 aa24.19■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TFAP2EQ6VUC0 442 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf40Q8WZ69 217 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX5Q99593 518 aa24.19■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP5EQ9NRR6 644 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR1DQ9Y2S0 133 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa24.19■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFP02787 698 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T7P0C7T2 308 aa24.18■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STK11Q15831 433 aa24.18■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T27Q8NH04 317 aa24.18■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa24.18■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf71A8MTZ7 269 aa24.17■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CDCA4Q9BXL8 241 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLE4Q9NR33 117 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MALT1Q9UDY8 824 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMP5Q9UJQ1 280 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED12LQ86YW9 2145 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
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