RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.11■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM219AQ8IW50 185 aa16.11■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF615Q8N8J6 731 aa16.11■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ALG12Q9BV10 488 aa16.11■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.11■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 NDUFA2O43678 99 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 AQP2P41181 271 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 SQSTM1Q13501 440 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 PLCL2Q9UPR0 1127 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 EFCAB7A8K855 629 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 LINC01387J3KSC0 135 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 MPGP29372 298 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 FASLGP48023 281 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ELOCQ15369 112 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 IL5P05113 134 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 GABRA4P48169 554 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 GMFBP60983 142 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 IL10RAQ13651 578 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 SERTAD2Q14140 314 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 MED25Q71SY5 747 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 C3orf49Q96BT1 292 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF576Q9H609 170 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 EML5Q05BV3 1969 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 HMSDA8MTL9 139 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TPPPO94811 219 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR76Q9H967 626 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 C17orf105B2RV13 164 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF749O43361 778 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 CLPSP04118 112 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB3AP20336 220 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 CD1CP29017 333 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 HSD17B7P56937 341 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 GUCA2BQ16661 112 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 Q499Y3 187 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHL26Q53HC5 615 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10K2Q6IF99 312 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 SYT13Q7L8C5 426 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF627Q7L945 461 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZFP82Q8N141 532 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16.09■□□□□ 0.17
TSPAN17-201ENST00000298564 H7C417 338 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 CCR4P51679 360 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 GAS6Q14393 721 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 CD226Q15762 336 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 BEST3Q8N1M1 668 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC43A2Q8N370 569 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 PDCD10Q9BUL8 212 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 SLITRK2Q9H156 845 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM231Q9H6L2 316 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM131Q92545 1883 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 OIP5O43482 229 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ALOX12BO75342 701 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 POU3F4P49335 361 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 CBLN3Q6UW01 205 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 AMELYQ99218 206 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 GLS2Q9UI32 602 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.08■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 BLACEA4D250 179 aa16.07■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 CTAG2O75638 210 aa16.07■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ATG12O94817 140 aa16.07■□□□□ 0.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ITGA5P08648 1049 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms