RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 KRBA1A5PL33 1030 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CTSCP53634 463 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SYT9Q86SS6 491 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NAXDQ8IW45 347 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PMP2P02689 132 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NME2P22392 152 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CCR7P32248 378 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CTBSQ01459 385 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SLC30A3Q99726 388 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CYTIPO60759 359 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 IER5LQ5T953 404 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TMEM106AQ96A25 262 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZFP92A6NM28 416 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TXNL1O43396 289 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TPBGQ13641 420 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PSD2Q9BQI7 771 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 GRINAQ7Z429 371 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TECTBQ96PL2 329 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 WNT7BP56706 349 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SORDQ00796 357 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CDH26Q8IXH8 852 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SYT5O00445 386 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 GJA4P35212 333 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LANCL2Q9NS86 450 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ITGB4P16144 1822 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RPE65Q16518 533 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 Q499Y3 187 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 BTNL8Q6UX41 500 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MED9Q9NWA0 146 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NUDT19A8MXV4 375 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 DRGXA6NNA5 263 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OPRL1P41146 370 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MS4A2Q01362 244 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TGM1P22735 817 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 VRK2Q86Y07 508 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 P2RY12Q9H244 342 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 EMC7Q9NPA0 242 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GTW7 788 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OPN1LWP04000 364 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR5G3P0C626 314 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 DUSP1P28562 367 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 GNB2P62879 340 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PMPCAQ10713 525 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 GHSRQ92847 366 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MBP02144 154 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 POU2F2P09086 479 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR51F2Q8NH61 342 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZNF778Q96MU6 729 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 SLC31A2O15432 143 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 PVRP15151 417 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CCL11P51671 97 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR5I1Q13606 314 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR4F5Q8NH21 305 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RLN3Q8WXF3 142 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 OR4F4Q96R69 305 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RNF32Q9H0A6 362 aa8.59□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 GRPP07492 148 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms