RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 BLVRAP53004 296 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 MYBPHQ13203 477 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 GPR148Q8TDV2 347 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TCEAL3Q969E4 200 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 C5orf34Q96MH7 638 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 CACNG2Q9Y698 323 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 MSX1P28360 303 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 HOXD12P35452 270 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 RGS19P49795 217 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 ROM1Q03395 351 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 PLA1AQ53H76 456 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 OR2M3Q8NG83 312 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 RNF128Q8TEB7 428 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 HSPB2A8KAH6 182 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 MASP2O00187 686 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 COX6A1P12074 109 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 HSPB2Q16082 182 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 FDX2Q6P4F2 183 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 KRT77Q7Z794 578 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 MCHR2Q969V1 340 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 LRP12Q9Y561 859 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC83-201ENST00000280245 A0A1W2PNR3 127 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 TMEM221A6NGB7 291 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 GPR171O14626 319 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 HLA-DMAP28067 261 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 PTGS2P35354 604 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 PITPNAQ00169 270 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 MC2RQ01718 297 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SLITRK2Q9H156 845 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 A6NIZ1 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CYC1P08574 325 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SDHBP21912 280 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 RAP1BP61224 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 RAP1AP62834 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CD83Q01151 205 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SIAH3Q8IW03 269 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 OR52N5Q8NH56 324 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CMTM3Q96MX0 182 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 RAF1P04049 648 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ARSBP15848 533 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 BIDP55957 195 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 PLA2G7Q13093 441 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 CENPBD1B2RD01 187 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC83-201ENST00000280245 ORC5O43913 435 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms