RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 APLNRP35414 380 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 DHRS2Q13268 280 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 NRMQ8IXM6 262 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 FIBINQ8TAL6 211 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 NKD1Q969G9 470 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 MED17Q9NVC6 651 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.78□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 IFITM5A6NNB3 132 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 SRMP19623 302 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 CD82P27701 267 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 BDH1Q02338 343 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 TAAR9Q96RI9 348 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.77□□□□□ -0.04
CBX8-201ENST00000269385 TSPAN11A1L157 253 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 C1orf226A1L170 272 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 RNF222A6NCQ9 220 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 BHLHE40O14503 412 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OR1F1O43749 312 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 AGR2O95994 175 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SOD3P08294 240 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ACTBP60709 375 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ACTG1P63261 375 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 LTBQ06643 244 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 NIPAL3Q6P499 406 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF727A8MUV8 499 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 M0QZK8 103 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 INSIG1O15503 277 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ST3GAL3Q11203 375 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 M1APQ8TC57 530 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.77□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 A0A1W2PQY0 241 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 PEX12O00623 359 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CD74P04233 296 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 TYRP1P17643 537 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SLC11A1P49279 550 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CIDEAO60543 219 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SFTPBP07988 381 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 TAF10Q12962 218 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 Q5PR19 223 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 RAB39BQ96DA2 213 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 GPA33Q99795 319 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 FGBP02675 491 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 EFNB1P98172 346 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 IL10RAQ13651 578 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CKAP5Q14008 2032 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 FJX1Q86VR8 437 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.76□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 A0A087WUU8 490 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 FBXO45P0C2W1 286 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OR8U9P0C7N5 309 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CDKN3Q16667 212 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 ZNF385BQ569K4 471 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 OR8U1Q8NH10 309 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 LGR4Q9BXB1 951 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 CWH43Q9H720 699 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 TUBA4BQ9H853 241 aa14.75□□□□□ -0.05
CBX8-201ENST00000269385 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms