RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A5P58743 744 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS3BPQ08380 585 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 POU4F3Q15319 338 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MED9Q9NWA0 146 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRG6 482 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR75O95800 540 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GUSBP08236 651 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CPMP14384 443 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FHL5Q5TD97 284 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRLBQ6BAA4 426 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRC3Q7RTR2 1065 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL9Q9P2J3 617 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZP1P60852 638 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RPTNQ6XPR3 784 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT1P19526 365 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR143P51810 404 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 BLVRAP53004 296 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX8P57073 446 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSWIM7Q19AV6 140 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PELI1Q96FA3 418 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 HRASLSQ9HDD0 168 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ICAM5Q9UMF0 924 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA7P05543 415 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GIPP09681 153 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GKN3PP0CG01 181 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DRD5P21918 477 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MNDAP41218 407 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFML2AQ68BL7 652 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPAT4Q86UL3 456 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FTMTQ8N4E7 242 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 COX18Q8N8Q8 333 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T4Q8NH00 348 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB40AQ8WXH6 277 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF426Q9BUY5 554 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAP2Q9NPF8 381 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 COL6A6A6NMZ7 2263 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0B4J2E0 115 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GX12 115 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPL8 197 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf105B2RV13 164 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 AIPO00170 330 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT33AO76009 404 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R3DO95685 299 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MECP2P51608 486 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP2BP61225 183 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35D3Q5M8T2 416 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS14Q8TCE9 139 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CSAG2Q9Y5P2 127 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPGP15A8MWD9 76 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 IL5P05113 134 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 UBL4AP11441 157 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PGDP52209 483 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00696Q6ZRV3 163 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM4Q8IZR5 234 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX33Q8WV41 574 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 FCAMRQ8WWV6 532 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A7Q92504 469 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM2Q9C040 744 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 BLACEA4D250 179 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 DDAH2O95865 285 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 F10P00742 488 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNGR1P15260 489 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SERTAD2Q14140 314 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LINGO2Q7L985 606 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS4Y2Q8TD47 263 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP5Q8TE02 316 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 DGAT2Q96PD7 388 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PPA2Q9H2U2 334 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF224Q9NZL3 707 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4AQ9UMR7 237 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV27A0A087WT01 109 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 G3V3Q6 166 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 HPXP02790 462 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CT62P0C5K7 136 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SRMP19623 302 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN5P62079 268 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53I3Q53FA7 332 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM65Q6PI78 240 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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