RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM209AQ5JX71 171 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA46Q5T0L3 261 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 HHATQ5VTY9 493 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 REEP3Q6NUK4 255 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC17Q8N6Y2 441 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2H4Q92759 462 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC58Q96CX6 371 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 EGLN1Q9GZT9 426 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF69Q9UC07 566 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP50Q9UKX7 468 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PRORSD1PA6NEY8 169 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-46P01743 117 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-13P01766 116 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 QDPRP09417 244 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IL13RA1P78552 427 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK6Q00534 326 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TGP01266 2768 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 UBDO15205 165 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CLRN1P58418 232 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP2Q14168 576 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC18Q8N456 261 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF607Q96SK3 696 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 AUP1Q9Y679 476 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MFN2O95140 757 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP1P29972 269 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF84P51523 738 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF718Q3SXZ3 478 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A28Q96A46 364 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 WNK2Q9Y3S1 2297 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CH25HO95992 272 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHG1P01857 330 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB108BQ8NET1 73 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB9Q96C00 473 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MCHR1Q99705 422 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC6Q9BQY6 131 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MRI1Q9BV20 369 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNN2Q9H2S1 579 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP1Q9NVV9 213 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 POM121CA8CG34 1229 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TPST2O60704 377 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2ABP04908 130 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SBK2P0C263 348 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PGA4P0DJD7 388 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PGA3P0DJD8 388 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 UMPSP11172 480 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MPV17P39210 176 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARB2Q14108 478 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 THEM4Q5T1C6 240 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC8Q8IUR7 673 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2ACQ93077 130 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 NANSQ9NR45 359 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP26Q9NRE1 261 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAL4EA0A075B759 164 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAL4DF5H284 164 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R3H8 397 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB7O75635 380 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 UBOX5O94941 541 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAL4FP0DN26 164 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF74Q16587 644 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 HIPK4Q8NE63 616 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF347Q96SE7 839 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R5Q9NYW4 299 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JK05 382 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MCIDASD6RGH6 385 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A2P23975 617 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP15P51511 669 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF154Q13106 437 aa23.14■■□□□ 1.29
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