RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615041.1

FAM49B-229, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 5 BASIC

Gene FAM49B, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-229	ENST00000615041	NPR2	P20594	1047 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	GABRR1	P24046	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SHMT2	P34897	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	GTF2B	Q00403	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ASPH	Q12797	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	PNOC	Q13519	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DUSP7	Q16829	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	NPY6R	Q99463	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041		A0A0J9YXY3	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041		A0A1B0GUA9	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CETN3	O15182	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	MBTPS2	O43462	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TSPAN12	O95859	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CLTA	P09496	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	UGT1A5	P35504	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	KLK7	P49862	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SEC61G	P60059	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OXA1L	Q15070	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DAW1	Q8N136	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	PCNT	O95613	3336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	SI	P14410	1827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CIT	O14578	2027 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CLDN9	O95484	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TNNC2	P02585	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	CCNE1	P24864	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DDOST	P39656	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	APOC4	P55056	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	UFD1	Q92890	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	ASB7	Q9H672	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041		A6NIZ1	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	GFY	I3L273	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	B4GALT5	O43286	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-229	ENST00000615041	EMC8	O43402	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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