RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 JMJD8Q96S16 334 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 EBF4Q9BQW3 602 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf198Q9H425 327 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ESM1Q9NQ30 184 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMS1P48059 325 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TSTQ16762 297 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC36A2Q495M3 483 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A14Q7RTX9 510 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PTOV1Q86YD1 416 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SUCNR1Q9BXA5 334 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NANSQ9NR45 359 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 EVPLLA8MZ36 301 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN25C9JDP6 229 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD52P43351 418 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IDH3AP50213 366 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKQ02763 1124 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MCHR2Q969V1 340 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF347Q96SE7 839 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L14Q9BZR8 327 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DECR2Q9NUI1 292 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 J3QLI3 93 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNAB3O43448 404 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAH2BP0C7U1 165 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST3H3Q16695 136 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 AWAT1Q58HT5 328 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM255AQ5JRV8 349 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF12L2Q5VW00 463 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DLEU7Q6UYE1 221 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC22Q8N966 263 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1J2Q8NGS2 313 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SAP30LQ9HAJ7 183 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF229Q9UJW7 825 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A7Q9UM01 511 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL10O95999 233 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PTHP01270 115 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHG1P01857 330 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MAKP20794 623 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CLRN1P58418 232 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NRN1LQ496H8 165 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC18Q8N456 261 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR1J1Q8NGS3 322 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NANPQ8TBE9 248 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TLCD1Q96CP7 247 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF426Q9BUY5 554 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN4Q9UHM6 478 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QX08 132 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-13P01766 116 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 UMPSP11172 480 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DRD4P21917 467 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PLP2Q04941 152 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HFEQ30201 348 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 AGKQ53H12 422 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RUNDC3AQ59EK9 446 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFB2Q8N4F0 458 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NOXO1Q8NFA2 376 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf26Q96N11 449 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8B1O43520 1251 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 FSHBP01225 129 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-46P01743 117 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND5P03915 603 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2ABP04908 130 aa21.77■■□□□ 1.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT14Q8NB59 555 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf15Q8WYQ4 148 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB1CQ92928 201 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMD4Q96H15 378 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPHS2Q99611 448 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf69Q9H7B7 122 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.77■■□□□ 1.08
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