RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 FMO3P31513 532 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACVR1BP36896 505 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDH11P55287 796 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ERVK-25P63136 954 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 EFNB1P98172 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACKR1Q16570 336 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SHFQ7M4L6 423 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FAM122BQ7Z309 247 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KIF18BQ86Y91 864 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 STX19Q8N4C7 294 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM99Q8N816 258 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RNF128Q8TEB7 428 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FAM168AQ92567 244 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC46Q96FV0 321 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GPA33Q99795 319 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HES7Q9BYE0 225 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 BCO1Q9HAY6 547 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 BATF3Q9NR55 127 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RASSF1Q9NS23 344 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RNF6Q9Y252 685 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HSPB2A8KAH6 182 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C11orf98E9PRG8 122 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RGS10O43665 173 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GLCEO94923 617 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 APOC1P02654 83 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TACSTD2P09758 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR2T7P0C7T2 308 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RAC2P15153 192 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF823P16415 610 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IL11P20809 199 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TIMP3P35625 211 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RFC3P40938 356 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CSNK1A1P48729 337 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PER3P56645 1201 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN20P56880 219 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PCBD1P61457 104 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACTA2P62736 377 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACTG2P63267 376 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SRYQ05066 204 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LTBQ06643 244 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CD47Q08722 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FHL1Q13642 323 aa6.51□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 LINC00303Q3SY05 128 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LEG1Q6P5S2 330 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 AAED1Q7RTV5 226 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CPOQ8IVL8 374 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.51□□□□□ -1.37
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