RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR119Q8TDV5 335 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF138Q8WVD3 245 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ST8SIA1Q92185 356 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 EXTL2Q9UBQ6 330 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GNG8Q9UK08 70 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM30A4D0T7 59 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOFO60613 162 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF432O94892 652 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ELK1P19419 428 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP2K6P52564 334 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 EGR3Q06889 387 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFL3Q6UXB1 125 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM220AQ7Z4H9 259 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD37Q7Z713 158 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC20BQ86Y33 519 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 COPS3Q9UNS2 423 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RASD1Q9Y272 281 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF281Q9Y2X9 895 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP7Q9Y680 259 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRK2Q5S007 2527 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 HMX3A6NHT5 357 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ENKURQ8TC29 256 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL15Q96M94 604 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSFQ9UBX1 484 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GNLYP22749 145 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 QPRTQ15274 297 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RPTNQ6XPR3 784 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5L2Q8NGL0 311 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZPLD1Q8TCW7 415 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM210AQ96ND0 272 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NEDD4LQ96PU5 975 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 LUZP4Q9P127 313 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED7Q9Y3B3 224 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PRG6 482 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 B4DXG7 233 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 DVL2O14641 736 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX4O60224 188 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ALOX12BO75342 701 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 HEXBP07686 556 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PITPNBP48739 271 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PITPNAQ00169 270 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TAB1Q15750 504 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B12Q53GQ0 312 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MESTQ5EB52 335 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51L1Q8NGJ5 315 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF121Q9H920 327 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR76Q9H967 626 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 INIPQ9NRY2 104 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MEIOCA2RUB1 952 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB13A6NJU9 1138 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 DDOSTP39656 456 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CD300CQ08708 224 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY14Q15391 338 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GXYLT1Q4G148 440 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATC1Q76KD6 591 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMD6Q96NE9 622 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R5Q9NYW4 299 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 IDSB3KWA1 339 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM10O14672 748 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SUSD5O60279 629 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNKO75909 580 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TPPPO94811 219 aa22.82■■□□□ 1.24
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