RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564582.2

CHD9-210, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene CHD9, Length 968 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-210ENST00000564582 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 A0A1W2PPC4 97 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 TRDCB7Z8K6 153 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 F5H0A9 414 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 F5H5T6 163 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 J3QRE1 110 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 SOCS5O75159 536 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 CD3GP09693 182 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 TACSTD2P09758 323 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 GAGE1Q13065 139 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 KLBQ86Z14 1044 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 GALNT16Q8N428 558 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 RNF152Q8N8N0 203 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 OR5R1Q8NH85 324 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 HSD17B8Q92506 261 aa5.05□□□□□ -1.6
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CHD9-210ENST00000564582 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 F2RL3Q96RI0 385 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 PRRT1Q99946 306 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 GGACTQ9BVM4 153 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 OR10A4Q9H209 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 ABCG8Q9H221 673 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 CWH43Q9H720 699 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 PDFQ9HBH1 243 aa5.05□□□□□ -1.6
CHD9-210ENST00000564582 APMAPQ9HDC9 416 aa5.05□□□□□ -1.6
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