RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM20	Q15388	145 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	MEP1B	Q16820	701 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TEX30	Q5JUR7	227 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RNF128	Q8TEB7	428 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR2A7	Q96R45	310 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT9	Q9BW91	350 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0C4DFX4	3053 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf98	E9PRG8	122 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SEC16A	O15027	2179 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CTAG2	O75638	210 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ROM1	Q03395	351 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RAB11B	Q15907	218 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH3	Q86UD3	253 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CARF	Q8N187	725 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF519	Q8TB69	540 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CHIA	Q9BZP6	476 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC17A2	O00624	439 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CCKBR	P32239	447 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ARL4D	P49703	201 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PNLIPRP2	P54317	469 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ACKR1	Q16570	336 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TOR2A	Q5JU69	321 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR8K3	Q8NH51	312 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SUN5	Q8TC36	379 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RBP7	Q96R05	134 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CKLF	Q9UBR5	152 aa		16.62	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		A8MVM7	634 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LMO7DN	F2Z398	122 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		H3BMH7	237 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CD2	P06729	351 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	M6PR	P20645	277 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	POU3F4	P49335	361 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DLX5	P56178	289 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	HSD11B2	P80365	405 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZP2	Q05996	745 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	KCNAB1	Q14722	419 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ODF4	Q2M2E3	257 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RLN3	Q8WXF3	142 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	AMELY	Q99218	206 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1C	Q13936	2221 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PR77	199 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PLSCR5	A0PG75	271 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR6C76	A6NM76	312 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		H0YC42	278 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GMFG	O60234	142 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SUSD5	O60279	629 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB7	O75200	414 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GPANK1	O95872	356 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFA	P04085	211 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	AKAIN1	P0CW23	69 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NSDHL	Q15738	373 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAM209A	Q5JX71	171 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	KRT77	Q7Z794	578 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CEP76	Q8TAP6	659 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		16.61	■□□□□ 0.25

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