RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	VLDLR	P98155	873 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG10	Q5BKT4	473 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK20	Q8IZL9	346 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK17	Q96T54	332 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CMAHP	Q9Y471	501 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WUU8	490 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHM	P01871	453 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF11	Q15544	211 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM107B	Q9H098	131 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A10	O95528	541 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF84	P51523	738 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MGRN1	O60291	552 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NR4A2	P43354	598 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FMOD	Q06828	376 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC36A2	Q495M3	483 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM162A	Q96A26	154 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NABP1	Q96AH0	204 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SIAE	Q9HAT2	523 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GMNC	A6NCL1	334 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A3	P48764	834 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GALK2	Q01415	458 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51A7	Q8NH64	312 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF519	Q8TB69	540 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG12	Q9BV10	488 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42EP2	O14613	210 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAP29	O95721	258 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRA2A	P08913	450 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CDA	P32320	146 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GYS2	P54840	703 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CTXN1	P60606	82 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GLYAT	Q6IB77	296 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	OAF	Q86UD1	273 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP11	Q86VZ4	500 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC18	Q8N456	261 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf34	Q96L11	122 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf198	Q9H425	327 aa		18.72	■□□□□ 0.59

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