RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 JAM3Q9BX67 310 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 ASAH2Q9NR71 780 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 ARL15Q9NXU5 204 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 KIF25Q9UIL4 384 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 GNG8Q9UK08 70 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 SSR3Q9UNL2 185 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPN3-211ENST00000562199 CNTNAP1P78357 1384 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PARP14Q460N5 1801 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1B0GTW7 788 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PSMB11A5LHX3 300 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CENPXA8MT69 81 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 BTN3A3O00478 584 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R2P9O14990 202 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 AIREO43918 545 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 TPST2O60704 377 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CDC14BO60729 498 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CREG1O75629 220 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 SLC25A12O75746 678 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CPNE6O95741 557 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 EDN1P05305 212 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 SPP1P10451 314 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 NR2F6P10588 404 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FOLR1P15328 257 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 C4BPBP20851 252 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 BCKDHBP21953 392 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CXCR1P25024 350 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ACADLP28330 430 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 GABRR2P28476 465 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PCSK6P29122 969 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FMO4P31512 558 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ARRB2P32121 409 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CNR2P34972 360 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ARL2P36404 184 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 IER3P46695 156 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 NUDT2P50583 147 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ACLYP53396 1101 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PLP1P60201 277 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 SELENOTP62341 195 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CDKL1Q00532 357 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF616Q08AN1 781 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 NFATC3Q12968 1075 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 SKP2Q13309 424 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 TPBGQ13641 420 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 GK3PQ14409 553 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 TAB1Q15750 504 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK14Q16539 360 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 DGUOKQ16854 277 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 BICRALQ6AI39 1079 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF529Q6P280 563 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FAHD1Q6P587 224 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 UQCC3Q6UW78 93 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 DLK2Q6UY11 383 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 COMMD7Q86VX2 200 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 SLC34A3Q8N130 599 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 OR51F2Q8NH61 342 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK15Q8TD08 544 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 FAM151AQ8WW52 585 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 C8orf44Q96CB5 159 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ORAI1Q96D31 301 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 YIPF6Q96EC8 236 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF75AQ96N20 296 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPN3-211ENST00000562199 MYADMQ96S97 322 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms