RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PPP5C	P53041	499 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	CRYBA2	P53672	197 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR3	P61158	418 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP4	Q09028	425 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE5	Q13069	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE6	Q13070	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SCARB2	Q14108	478 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	VEZF1	Q14119	521 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NNAT	Q16517	81 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK14	Q16539	360 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	HSDL2	Q6YN16	418 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	DHFR2	Q86XF0	187 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BCORP1	Q8N888	145 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OR4C3	Q8NH37	302 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NUBPL	Q8TB37	319 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	M1AP	Q8TC57	530 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TAMM41	Q96BW9	452 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	VMP1	Q96GC9	406 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ART5	Q96L15	291 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OLAH	Q9NV23	265 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	LIPT1	Q9Y234	373 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	CFL2	Q9Y281	166 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	DMD	P11532	3685 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF292	O60281	2723 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ARGFX	A6NJG6	315 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN24	A6NM45	220 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OR6C76	A6NM76	312 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	C5orf58	C9J3I9	102 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	P2RY10	O00398	339 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ARPC2	O15144	300 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN2	O60636	221 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	STX11	O75558	287 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	REM1	O75628	298 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	UGT2B17	O75795	530 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OR2J2	O76002	312 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	EPPIN	O95925	133 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	HP	P00738	406 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA1	P01009	418 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	OPN1SW	P03999	348 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ALPP	P05187	535 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA7	P05543	415 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BCHE	P06276	602 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPA8	P0DM63	369 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ICAM2	P13598	275 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ETS2	P15036	469 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	KHK	P50053	298 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	MLF1	P58340	268 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	SELENOW	P63302	87 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	BNIP2	Q12982	314 aa		3.94	□□□□□ -1.78

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