RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-205	ENST00000558534	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PLP2	Q04941	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SEC23B	Q15437	767 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LIME1	Q9H400	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PTP4A3	O75365	173 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PLAU	P00749	431 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CST1	P01037	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PAX1	P15863	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	NOS3	P29474	1203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	FABP6	P51161	128 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	RAB1A	P62820	205 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ERVK-25	P63136	954 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	GALK2	Q01415	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	NAAA	Q02083	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ETFDH	Q16134	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	RFX4	Q33E94	735 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	RNF121	Q9H920	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	POMP	Q9Y244	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CIB2	O75838	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CECR9	P0C854	216 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CRABP1	P29762	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	GSS	P48637	474 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	NPRL3	Q12980	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	MDP1	Q86V88	176 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	MUC15	Q8N387	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	EBAG9	O00559	213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ARPC3	O15145	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SEC14L2	O76054	403 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	TXNDC12	O95881	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	REN	P00797	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	HLA-H	P01893	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	DANCR	P0C864	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	TTK	P33981	857 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	COX10	Q12887	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	FHL1	Q13642	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	TESK1	Q15569	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	MICA	Q29983	383 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-205	ENST00000558534	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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