RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF254O75437 659 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IGKV3-11P04433 115 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RLN1P04808 185 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 HLA-DOBP13765 273 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CTLA4P16410 223 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 POU3F4P49335 361 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 AP3S2P59780 193 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GPR148Q8TDV2 347 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR1D5P58170 312 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OTOSQ8NHW6 89 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 B9D1Q9UPM9 204 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MED12Q93074 2177 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LINC00862A6NCI5 91 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 XKRYO14609 159 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CTAG2O75638 210 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 BIKQ13323 160 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ELOCQ15369 112 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NSDHLQ15738 373 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM205Q6UW68 189 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 COMMD7Q86VX2 200 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 WDFY1Q8IWB7 410 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GPR119Q8TDV5 335 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.98■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TLCD2A6NGC4 264 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FRG2CA6NGY1 282 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 H0YIG0 161 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TEX46H3BTG2 121 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 M0R233 179 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SUN5Q8TC36 379 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GINS4Q9BRT9 223 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CHST6Q9GZX3 395 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LAT2Q9GZY6 243 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NDUFB6O95139 128 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR1L3Q8NH93 324 aa15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM212A6NML5 194 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 XRCC3O43542 346 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SULT1B1O43704 296 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SUSD5O60279 629 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SLC25A12O75746 678 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RBBP9O75884 186 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SLC17A1Q14916 467 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OPCMLQ14982 345 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR10K2Q6IF99 312 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MCHR2Q969V1 340 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PMEPA1Q969W9 287 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OMA1Q96E52 524 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 BLACEA4D250 179 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GGT3PA6NGU5 568 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LMX1BO60663 402 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PRAF2O60831 178 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR6A2O95222 327 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IGLV3-19P01714 112 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CD38P28907 300 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ARPC4P59998 168 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ADAM8P78325 824 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms