RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK20Q8IZL9 346 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM255BQ8WV15 326 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HPS1Q92902 700 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB9Q96DX5 294 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PYURFQ96I23 114 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRR1Q96L50 414 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.78■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRG6 482 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM129A0AVI4 362 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRN3E7EW58 273 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 J3KTA2 159 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP5HO75947 161 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR7A10O76100 309 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HPRP00739 348 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CELA3BP08861 270 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TACSTD2P09758 323 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHN2P52757 468 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CR1LQ2VPA4 569 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTX3Q5HYI7 312 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARD17Q5XLA6 110 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRM2BQ7LG56 351 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF786Q8N393 782 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SVOPLQ8N434 492 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRLF2Q9HC73 371 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRP5LA4QPB2 252 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCIDASD6RGH6 385 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R3G1 203 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSC2O15499 205 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUT1P19526 365 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK1A1P48729 337 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BIDP55957 195 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CBX1P83916 185 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM123Q8N131 208 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOX7Q9BT81 388 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED29Q9NX70 200 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.76■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LILRA1O75019 489 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL10O95999 233 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DOBP13765 273 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNGR1P15260 489 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGA2P17301 1181 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UGT2B15P54855 530 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MDP1Q86V88 176 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHFR2Q86XF0 187 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6X1Q8NH79 312 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFN4Q8NHR9 129 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EMC6Q9BV81 110 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HAX1O00165 279 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFI30P13284 250 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHCEP18577 417 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RASSF2P50749 326 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPRL3Q12980 569 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMK2DQ13557 499 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAG1Q14118 895 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF11Q15544 211 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIPHQ8WWY8 451 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF566Q969W8 418 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms