RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ATXN3-222	ENST00000553570	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A0J9YW62	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570		B4DXG7	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570		M0QX08	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SULT2B1	O00204	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FBP2	O00757	339 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	EFNA2	O43921	213 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	GMNN	O75496	209 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SERPINB7	O75635	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TOX	O94900	526 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	PGM3	O95394	542 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TGM6	O95932	706 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	IFNA2	P01563	188 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	OPN1SW	P03999	348 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NGFR	P08138	427 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF708	P17019	499 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CBL	P22681	906 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CDA	P32320	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	OPRM1	P35372	400 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NR4A2	P43354	598 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC6A8	P48029	635 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CLDN18	P56856	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NCALD	P61601	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FUT5	Q11128	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FOXF1	Q12946	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	BNIP2	Q12982	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FADD	Q13158	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	MYBPH	Q13203	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SELPLG	Q14242	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	FIG4	Q92562	907 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	RCN3	Q96D15	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-222	ENST00000553570	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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