RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FOXB1Q99853 325 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-209ENST00000550857 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-209ENST00000550857 C10orf90Q96M02 699 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-209ENST00000550857 CA10Q9NS85 328 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LUZP4Q9P127 313 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 EPOPA6NHQ4 379 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 G3V2L1 256 aa7.32□□□□□ -1.24
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