RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TMCC2	O75069	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SOX6	P35712	828 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GFRA1	P56159	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RUNX1T1	Q06455	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DOC2B	Q14184	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	POU4F3	Q15319	338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610		A0A087WV48	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KLK10	O43240	276 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CLPX	O76031	633 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LALBA	P00709	142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KRT8	P05787	483 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CTLA4	P16410	223 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GAL	P22466	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RFC3	P40938	356 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CLDN20	P56880	219 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC10A1	Q14973	349 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TIMP4	Q99727	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KALRN	O60229	2985 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PLPP2	O43688	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SULT1C4	O75897	302 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MAGEA5	P43359	124 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	STAR	P49675	285 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ENTPD1	P49961	510 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TNFSF10	P50591	281 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CLDN17	P56750	224 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SIRPA	P78324	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ADAM8	P78325	824 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EGR3	Q06889	387 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GGN	Q86UU5	652 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CXCL13	O43927	109 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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