RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KLK1	P06870	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LYN	P07948	512 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RET	P07949	1114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NCK1	P16333	377 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GGT1	P19440	569 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ACKR3	P25106	362 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FAS	P25445	335 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINB1	P30740	379 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CDKN2C	P42773	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MTPN	P58546	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RBBP4	Q09028	425 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TRIP10	Q15642	601 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZIC1	Q15915	447 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C3AR1	Q16581	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908		Q6ZSR6	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CEP290	O15078	2479 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PCM1	Q15154	2024 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	UPK1A	O00322	258 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CXCR6	O00574	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DLGAP1	O14490	977 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PLPP1	O14494	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CCS	O14618	274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CLOCK	O15516	846 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR1F1	O43749	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SEMA4F	O95754	770 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TNF	P01375	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PSMB5	P28074	263 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AKT2	P31751	481 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KDELR2	P33947	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NUDT1	P36639	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ARFIP1	P53367	373 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AQP4	P55087	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	STARD6	P59095	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	REEP5	Q00765	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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