RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531318.1

NFRKB-208, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, human

TSL 4

Gene NFRKB, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFRKB-208	ENST00000531318	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	AUP1	Q9Y679	476 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PLSCR5	A0PG75	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	POM121C	A8CG34	1229 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PLPP3	O14495	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	DHH	O43323	396 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	RNF13	O43567	381 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TYROBP	O43914	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TPST1	O60507	370 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC22A3	O75751	556 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PTH	P01270	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	QDPR	P09417	244 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	CLRN1	P58418	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC3A1	Q07837	685 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF154	Q13106	437 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	STX3	Q13277	289 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OR1Q1	Q15612	314 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	MOG	Q16653	247 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC36A2	Q495M3	483 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SPRN	Q5BIV9	151 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ULK3	Q6PHR2	472 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF627	Q7L945	461 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PXK	Q7Z7A4	578 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	COMTD1	Q86VU5	262 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	HIPK4	Q8NE63	616 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OR5J2	Q8NH18	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF566	Q969W8	418 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ITCH	Q96J02	903 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PKP2	Q99959	881 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	MRI1	Q9BV20	369 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	C1orf198	Q9H425	327 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	RMND5A	Q9H871	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	C12orf10	Q9HB07	376 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	NPTN	Q9Y639	398 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	C5orf49	A4QMS7	147 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	CLIC1	O00299	241 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	FZD7	O75084	574 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ENTPD5	O75356	428 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	UBOX5	O94941	541 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	CH25H	O95992	272 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KNG1	P01042	644 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV3-13	P01766	116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHM	P01871	453 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	IL6	P05231	212 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	UMPS	P11172	480 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	AQP1	P29972	269 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF84	P51523	738 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	CDH12	P55289	794 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	BST1	Q10588	318 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	RGN	Q15493	299 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OGFOD2	Q6N063	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	PARP8	Q8N3A8	854 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SYT14	Q8NB59	555 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	OR6X1	Q8NH79	312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2F	Q969M7	185 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC35B4	Q969S0	331 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF347	Q96SE7	839 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFRKB-208	ENST00000531318	DIRC2	Q96SL1	478 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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