RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 Q9H521 79 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GMPPBQ9Y5P6 360 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MED12LQ86YW9 2145 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF726A6NNF4 738 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF724A8MTY0 619 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 BHLHE40O14503 412 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 XKRYO14609 159 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RAMP1O60894 148 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R3DO95685 299 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TXNDC12O95881 172 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IFNGP01579 166 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IGHMP01871 453 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 YES1P07947 543 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IFNGR1P15260 489 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SDHAP31040 664 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GGT2P36268 569 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IL18R1Q13478 541 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM201Q5SNT2 666 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 C22orf34Q6ZV56 151 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CREB3L2Q70SY1 520 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SETD9Q8NE22 299 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TFAP2CQ92754 450 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 COX4I2Q96KJ9 171 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IMPAD1Q9NX62 359 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TVP23BQ9NYZ1 205 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL21Q9UJP4 597 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RAB26Q9ULW5 256 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 EMC9Q9Y3B6 208 aa10□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM64BA6NI03 449 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF716A6NP11 495 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 M0R3G1 203 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 AHCYL1O43865 530 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MPZL2O60487 215 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NR2C1P13056 603 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-DOBP13765 273 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PCSK6P29122 969 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 EPHA2P29317 976 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ACVR1BP36896 505 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 BIDP55957 195 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN17P56750 224 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GUSBP1Q15486 140 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SNAPC1Q16533 368 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 C12orf73Q69YU5 71 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 AAED1Q7RTV5 226 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM122BQ7Z309 247 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ADCK1Q86TW2 530 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR6X1Q8NH79 312 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FNDC8Q8TC99 324 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ABHD3Q8WU67 409 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 Q96M85 177 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 DOCK7Q96N67 2140 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PITX2Q99697 317 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 BCO1Q9HAY6 547 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RCE1Q9Y256 329 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35F4A4IF30 521 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CENPBD1B2RD01 187 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 E9PQ18 207 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RENP00797 406 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ACADSP16219 412 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF3P17036 446 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 BEX5Q5H9J7 111 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms