RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SLC17A2O00624 439 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RAD51BO15315 384 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PSTPIP1O43586 416 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR7A10O76100 309 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CA1P00915 261 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 IL6P05231 212 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR9G9P0C7N8 305 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SLC35E2BP0CK96 405 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SLC35E2P0CK97 266 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G2AP14555 144 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CTRB1P17538 263 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TBPP20226 339 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CFL1P23528 166 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CMA1P23946 247 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PDHA2P29803 388 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CCKARP32238 428 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SLC1A1P43005 524 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 XCR1P46094 333 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SSR4P51571 173 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CEBPGP53567 150 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ITIH4Q14624 930 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFA5Q16718 116 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FAM120AOSQ5T036 256 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CTRB2Q6GPI1 263 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 C11orf71Q6IPW1 123 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SPESP1Q6UW49 350 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FGFRL1Q8N441 504 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FBXL16Q8N461 479 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FNDC5Q8NAU1 212 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PROKR2Q8NFJ6 384 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 B3GNT7Q8NFL0 401 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR52B6Q8NGF0 335 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR5L2Q8NGL0 311 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TEX47Q8TBZ9 253 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DYDC1Q8WWB3 177 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CRYGNQ8WXF5 182 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OTUB2Q96DC9 234 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R16AQ96I34 528 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TECTBQ96PL2 329 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CSPG4P5Q96PW8 444 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RNF2Q99496 336 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SELENOSQ9BQE4 189 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OCR1Q9BZK8 76 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PPA2Q9H2U2 334 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PARVBQ9HBI1 364 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ADAP2Q9NPF8 381 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CTSFQ9UBX1 484 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PSMD13Q9UNM6 376 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1671Q9BY89 1806 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GWB2 263 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF33A8MVX0 844 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CCNB2O95067 398 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SNAPINO95295 136 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3-9P01782 118 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MMP1P03956 469 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PRKACGP22612 351 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PTGDSP41222 190 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NSG1P42857 185 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 POU3F4P49335 361 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGDIAP52565 204 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 IST1P53990 364 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 STX17P56962 302 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PRPS1P60891 318 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CDC20Q12834 499 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CDH17Q12864 832 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR5I1Q13606 314 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 KCNJ11Q14654 390 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 LTB4RQ15722 352 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CCL14Q16627 93 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC26Q2I0M4 334 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DMRTC1Q5HYR2 192 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A13Q5J8X5 152 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SLC16A14Q7RTX9 510 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DCXRQ7Z4W1 244 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 VRK2Q86Y07 508 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ENTHD1Q8IYW4 607 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TPRX1Q8N7U7 411 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ZNRF1Q8ND25 227 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF740Q8NDX6 193 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR2T6Q8NHC8 308 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RHEBL1Q8TAI7 183 aa1.83□□□□□ -2.12
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