RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	CASP4	P49662	377 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	UGT2B15	P54855	530 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	NUCB2	P80303	420 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OR5I1	Q13606	314 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	RGN	Q15493	299 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	PGGHG	Q32M88	737 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	THEM4	Q5T1C6	240 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEP112	Q8N8E3	955 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CLCC1	Q96S66	551 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		0.43	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CACNA1G	O43497	2377 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM170A	A1A519	330 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	HIDE1	A8MVS5	230 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZSCAN12	O43309	604 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MED7	O43513	233 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATP5L	O75964	103 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	HRES1	P13985	223 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCDC130	P13994	396 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SSTR5	P35346	364 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEACAM6	P40199	344 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SYK	P43405	635 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	P2RY1	P47900	373 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ACADVL	P49748	655 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OGDH	Q02218	1023 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	DUSP7	Q16829	419 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	STUM	Q69YW2	141 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAB12	Q6IQ22	244 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARL9	Q6T311	187 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM3C	Q92520	227 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	NTAN1	Q96AB6	310 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SAMD8	Q96LT4	415 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF488	Q96MN9	340 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	C18orf15	Q96N68	181 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPAST	Q9UBP0	616 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FETUB	Q9UGM5	382 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	KDR	P35968	1356 aa		0.42	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRP5L	A4QPB2	252 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OR5B21	A6NL26	309 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075		H0YJW9	148 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	C3orf84	H3BNL1	204 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	HLA-DPA1	P20036	260 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	NT5E	P21589	574 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MMP11	P24347	488 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	HRH1	P35367	487 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SERPINB5	P36952	375 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	BIK	Q13323	160 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM53B	Q14153	422 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	PON2	Q15165	354 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	HGD	Q93099	445 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	WDR34	Q96EX3	536 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MED8	Q96G25	268 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OXGR1	Q96P68	337 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATP6V0B	Q99437	205 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	P2RX4	Q99571	388 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	OR52D1	Q9H346	318 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	THAP9	Q9H5L6	903 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	BFAR	Q9NZS9	450 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	MSH6	P52701	1360 aa		0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
ARRDC3-204	ENST00000507075	C4orf51	C9J302	202 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ARRDC3-204	ENST00000507075	TOM1	O60784	492 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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