RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 TIRAPP58753 221 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 MERTKQ12866 999 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 COX10Q12887 443 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 BCL2A1Q16548 175 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RFX4Q33E94 735 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 SLC36A3Q495N2 470 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 GXYLT1Q4G148 440 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RRM2BQ7LG56 351 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ZNF563Q8TA94 476 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMEM239Q8WW34 195 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ST8SIA1Q92185 356 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RDH12Q96NR8 316 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PRR25Q96S07 402 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PIGQQ9BRB3 760 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 UCK2Q9BZX2 261 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 VCXQ9H320 206 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 EXO5Q9H790 373 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 KRT84Q9NSB2 600 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RAB26Q9ULW5 256 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.1□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 A0A0J9YW62 118 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMEM72A0PK05 275 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 WIPF3A6NGB9 483 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CLCA1A8K7I4 914 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 H0YAE9 185 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 BCKDKO14874 412 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PIP5K1CO60331 668 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 JTBO76095 146 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ADAP00813 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TPOP07202 933 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 STSP08842 583 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PNMTP11086 282 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PEPDP12955 493 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CPN1P15169 458 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ABOP16442 354 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 IGFBP5P24593 272 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CXCR1P25024 350 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ELK4P28324 431 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 IFNGR2P38484 337 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 HTR3AP46098 478 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 HSPA13P48723 471 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CRISP1P54107 249 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RAD23AP54725 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CTBP2P56545 445 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 IL1RL1Q01638 556 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 EGR4Q05215 589 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RBPJQ06330 500 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 LTBQ06643 244 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 NPRL3Q12980 569 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TSPAN31Q12999 210 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RTL6Q6ICC9 239 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 GRINAQ7Z429 371 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 P3H2Q8IVL5 708 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 NRMQ8IXM6 262 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PARP8Q8N3A8 854 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PFN4Q8NHR9 129 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PIGXQ8TBF5 258 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMEM234Q8WY98 164 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 SMPDL3BQ92485 455 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 ADGRG7Q96K78 797 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 MBOAT4Q96T53 435 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.09□□□□□ -1.43
TPR-208ENST00000492973 SELENONQ9NZV5 590 aa6.09□□□□□ -1.43
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