RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FADS1O60427 444 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TIAF1O95411 115 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RENP00797 406 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RAF1P04049 648 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ALOX5APP20292 161 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 STARD6P59095 220 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 STK11Q15831 433 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ACKR1Q16570 336 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RDH8Q9NYR8 311 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TO15178 435 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A12O75746 678 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DQA2P01906 255 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 DPP4P27487 766 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MMP15P51511 669 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G7Q13093 441 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 GPR119Q8TDV5 335 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RBP7Q96R05 134 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 C7orf66A4D0T2 115 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CPED1A4D0V7 1026 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ADAM10O14672 748 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TACSTD2P09758 323 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ANXA3P12429 323 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PGCP20142 388 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MELKQ14680 651 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ANGPT1Q15389 498 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 LUZP2Q86TE4 346 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 NSMAFQ92636 917 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 GPR137Q96N19 417 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 INTS14Q96SY0 518 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 C12orf10Q9HB07 376 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 V9GY05 133 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 H0YC42 278 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DOBP13765 273 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PNLIPRP2P54317 469 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 FBXW4P57775 412 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MEP1BQ16820 701 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SLC6A19Q695T7 634 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 LINGO2Q7L985 606 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 B9D1Q9UPM9 204 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MUC3AQ02505 3323 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 AIPO00170 330 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SSNA1O43805 119 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SLC16A7O60669 478 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MAS1P04201 325 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 GDNFP39905 211 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RNF4P78317 190 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PITPNAQ00169 270 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CBFBQ13951 182 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 EMC4Q5J8M3 183 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MDGA2Q7Z553 956 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 KLHL15Q96M94 604 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MFRPQ9BY79 579 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQD3 144 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 LINC00862A6NCI5 91 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 K7ESF4 209 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 XKRYO14609 159 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MPZL1O95297 269 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 WNT11O96014 354 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms