RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	COPE	O14579	308 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MELTF	P08582	738 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CBL	P22681	906 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CASQ1	P31415	396 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PLP2	Q04941	152 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OPN1MW	P04001	364 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	WNT2	P09544	360 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	MPV17	P39210	176 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	PUDP	Q08623	228 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	COX20	Q5RI15	118 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ASPN	Q9BXN1	380 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	APLNR	P35414	380 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	CRISP3	P54108	245 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	NRN1L	Q496H8	165 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390		H0YL77	283 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	DHH	O43323	396 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR137B	O60478	399 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	BGLAP	P02818	100 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	TNFRSF1A	P19438	455 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	BID	P55957	195 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	HOXC5	Q00444	222 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SHOC2-205	ENST00000489390	EPYC	Q99645	322 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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