RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PYURF	Q96I23	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		E7EQL1	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RGS13	O14921	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AHCYL1	O43865	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC43A1	O75387	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PDE5A	O76074	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UBOX5	O94941	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TXNDC12	O95881	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	WNT11	O96014	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF35	P13682	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IFNGR1	P15260	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FOSL1	P15407	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CBR1	P16152	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DNASE1	P24855	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CALCR	P30988	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AQP2	P41181	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GIPR	P48546	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GSS	P48637	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TAS2R41	P59536	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PRPS1	P60891	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FMOD	Q06828	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BNIP1	Q12981	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DDO	Q99489	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMR3A	Q99954	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		U3KQE9	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		V9GYQ6	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ABCD4	O14678	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARPC3	O15145	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CLOCK	O15516	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DHH	O43323	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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