RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478693.1

SRRT-211, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-211ENST00000478693 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 UBL3O95164 117 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TXNDC12O95881 172 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 IFNGP01579 166 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 IGFBP5P24593 272 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CDAP32320 146 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SGCAQ16586 387 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HIST3H3Q16695 136 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PGGHGQ32M88 737 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 C10orf128Q5T292 105 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 LRRC18Q8N456 261 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 WDR31Q8NA23 367 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HTRA1Q92743 480 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 OTULINQ96BN8 352 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 NMNAT3Q96T66 252 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 NELFAQ9H3P2 528 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 FN3KQ9H479 309 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RNF121Q9H920 327 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 H0YHG0 523 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 BHLHE40O14503 412 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HLA-HP01893 362 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CD3EP07766 207 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CTLA4P16410 223 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ZNF3P17036 446 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 NPR2P20594 1047 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CRABP1P29762 137 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 GRK5P34947 590 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 DAPP51397 102 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PIGFQ07326 219 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 GSG1Q2KHT4 349 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SLC36A2Q495M3 483 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 FAHD1Q6P587 224 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 MDP1Q86V88 176 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CIB1Q99828 191 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 SH3GL3Q99963 347 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RASSF1Q9NS23 344 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TENM4Q6N022 2769 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 EI24O14681 340 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 CTAG2O75638 210 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HLA-DQA2P01906 255 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 HRGP04196 525 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PRF1P14222 555 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 MSR1P21757 451 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PAX7P23759 505 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 PTAFRP25105 342 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ESRRGP62508 458 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 BSPH1Q075Z2 132 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 GINS1Q14691 196 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 RCN1Q15293 331 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 ETFDHQ16134 617 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.94□□□□□ -0.82
SRRT-211ENST00000478693 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms